《张氏医通》是其主要代表著作，共十六卷。内容以杂病为主，兼及外感，分内、外、妇、儿、五官等各科疾病的证治，并附以验案，其中卷一至卷七为内科，卷八为五官科，卷九为外科，卷十、卷十一上编为妇科，卷十一下篇、卷十一为小儿科，卷十三至卷十五为专方，卷十六为祖方。先将各科疾病分门别类，再按照具体疾病与证候类型阐述病因病机，进而确定相应的治疗方法，选择的对方药，并解说方药配伍特点，与应用思路及其加减变化，《张氏医通》引用医学广博，上自《素问》、《灵枢》，下达当时医著举凡130余种。

卷一

　中风门

　中风

　口眼喁斜

　口噤不开

　痰涎壅盛

　语言蹇涩

　左瘫右痪

　角弓反张

　四肢不举

　麻瞀不仁

　表虚自汗

　神气昏冒

　遗尿不禁

　不治诸证

卷二

　诸伤门

　伤寒

　阴阳传中

　冬温

.　温病

　热病

　时行

　暑

　湿

　燥

　火

　伤饮食

　劳倦

　虚损

卷三

　寒热门

　发热

　热

　潮热

　恶寒

　振寒

　战傈

　寒热

　疟

　厥

　诸气门上

　气

　郁

　痞满

　腹满

　水肿

　鼓胀

　……

卷四

卷五

卷六

卷七

卷八

卷九

卷十

卷十一

卷十二

卷十三 专方

卷十四

卷十五

卷十六 祖方

附 张介宾八略总论

附录